冠状沟有小肉芽的原因可能与珍珠疹、尖锐湿疣、传染性软疣、扁平疣、肿瘤有关，当冠状沟出现小肉芽时，应避免擅自使用药物，以免导致病情加重，而是建议及时就医，待明确原因后，再积极进行治疗。

1、珍珠疹：又称珍珠状阴茎丘疹，可能与包皮过长、局部卫生状况差、冠状沟分泌物及污垢的长期刺激、精神压力过大等因素有关，常表现为阴茎冠状沟边缘出现珍珠状、半透明的丘疹，通常互不融合。因此，当患者出现冠状沟有小肉芽时，可能是珍珠疹引起的，一般不需要特殊处理;

2、尖锐湿疣：是由于性接触、间接接触等原因导致人乳头瘤病毒感染引起的，主要表现为冠状沟或龟头冠状沟部位出现肉芽状或者鸡冠状的赘生物，即小肉芽，还可能伴有瘙痒、疼痛等症状。因此，当患者出现冠状沟有小肉芽时，可能是尖锐湿疣引起的，建议及时到医院就诊，并在医生的指导下使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等药物进行治疗，还可以在医生的指导下采用激光、冷冻、微波等物理方法进行治疗;

3、传染性软疣：可能与性传播、间接接触传播等原因有关，其主要表现为皮损部位出现半透明或珍珠状的丘疹，并且丘疹中间有乳白色的脓包，即小肉芽，如果冠状沟部位同时感染了其他类型的病毒，也可能会导致冠状沟有小肉芽;

4、扁平疣：可能与自身免疫力下降、外伤、皮肤破损等原因有关，其主要表现为略微隆起、表面光滑的扁平丘疹，好发于面部、手背等位置，当发生于龟头时，也可能引起冠状沟有小肉芽的现象;

5、肿瘤：通常是由于病毒感染、过敏、慢性炎症刺激等因素引起的，常表现为龟头冠状沟部位出现一个或多个肉芽状的肿物，可能伴有瘙痒、疼痛等症状。因此，当患者出现冠状沟有小肉芽时，可能是肿瘤引起的，建议及时到医院就诊，并在医生的指导下进行手术治疗、放疗、化疗等治疗。